権殿は本殿などを修理する際、一時的に御神体をおうつしする建物です。規模は本殿の七割と小さいながら五間社流造りでこちらも重要文化財に指定されています。現在の建物は1645年に再興されたものです。　
権殿左側の石段を上ると稲荷山への入り口へと続きます。